circRNA研究汇总(20200511-20200517)
欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
- CircITCH海绵吸附miR-330-5p上调SIRT6、Survivin和SERCA2a改善阿霉素诱导的心脏毒性。
标题:The Tumor-Suppressive Human Circular RNA CircITCH Sponges miR-330-5p to Ameliorate Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity Through Upregulating SIRT6, Survivin, and SERCA2a.
杂志:Circ Res;影响因子:15.862
通讯作者:曹丰教授(西京医院、解放军总院)
阿霉素(DOX)是目前最有效的抗肿瘤药物之一。然而,阿霉素具有严重心脏毒性的风险,使其临床用途受到限制。先前的工作已经确定CircITCH是一种广谱抑制肿瘤的环状RNA,其宿主基因ITCH与阿霉素诱导的心脏毒性(DOXIC)有关。CircITCH是否在DOXIC中发挥作用尚不清楚。该研究旨在剖析CircITCH在DOXIC中的作用,并进一步解读其潜在机制。研究者首先通过circRNA测序以筛选阿霉素诱导的心脏毒性发病机制中可能涉及的circRNA。qPCR和RNA ISH(原位杂交)显示,在DOX处理的人诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CM)以及DOX诱导心肌毒性死亡的癌症患者尸检样本中,CircITCH显著下调。细胞生存力测定、心肌细胞坏死标志物的检测和心肌细胞功能测定表明,CircITCH改善了DOX诱导的心肌细胞损伤和功能障碍。细胞/线粒体氧化应激和DNA损伤标记的检测证实CircITCH减轻了DOX诱导的细胞/线粒体氧化应激和DNA损伤。RNA-pulldown测定,Ago2免疫沉淀和双荧光检测实验确定miR-330-5p为CircITCH的直接靶标。此外,发现CircITCH起到隔离miR-330-5p的内源性海绵作用。生物信息学分析,荧光素酶报告基因和qPCR实验结果表明,SIRT6,BIRC5(Survivin)和ATP2A2(SERCA2a)是miR-330-5p的直接靶标,并且它们受DOXIC中CircITCH / miR-330-5p轴的调控。进一步的实验表明,CircITCH介导的DOXIC缓解取决于miR-330-5p与SIRT6,BIRC5和ATP2A2 mRNA的3′-UTR之间的相互作用。最后,AAV9包装CircITCH过表达载体部分阻止了小鼠的阿霉素诱导的心脏毒性(DOXIC)。因此,该研究结论表明CircITCH代表DOXIC的新型治疗靶标,CircITCH充当miR-330-5p的天然海绵,从而上调SIRT6,Survivin和SERCA2a减轻DOX诱导的心肌细胞损伤和功能障碍。
图注:CircITCH改善阿霉素诱导的心脏毒性的功能机制示意图
- 环状RNA STAG1调节星形胶质细胞功能障碍和抑郁样行为中的脂肪酸酰胺水解酶信使RNA的m6A修饰。
标题:N6-Methyladenosine Modification of Fatty Acid Amide Hydrolase Messenger RNA in Circular RNA STAG1-Regulated Astrocyte Dysfunction and Depressive-like Behaviors.
杂志:Biol Psychiatry;影响因子:11.501
通讯作者:姚红红教授(东南大学医学院)
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物信使RNA中最丰富的表观遗传修饰,对于生理、病理过程中的多个RNA处理事件至关重要。但是m6A甲基化在抑郁症(MDD)中的作用还不甚清楚。研究者首先使用高通量RNA测序从慢性不可预测性温和应激诱导的抑郁样小鼠海马中筛选出环状RNA STAG1(circSTAG1),随后将circSTAG1慢病毒微注射到小鼠海马中,观察circSTAG1在抑郁症中的作用。进行蔗糖偏爱,强迫游泳和悬尾测试以评估小鼠的抑郁样行为。研究结果显示:慢性不可预测应激小鼠海马和MDD患者的外周血中circSTAG1显著降低。circSTAG1的过表达显著减轻了由慢性不可预测压力引起的星形胶质细胞功能障碍和抑郁样行为。进一步的检查表明,过表达的circSTAG1捕获了ALKBH5,并减少了ALKBH5进入细胞核的转运,导致星形胶质细胞中脂肪酸酰胺水解酶(FAAH)mRNA的m6A甲基化增加和FAAH降解,进而降低了抑郁样行为和皮质酮体外诱导的星形胶质细胞损伤。该研究发现剖析了在MDD背景下circSTAG1和m6A甲基化之间的功能联系,为circSTAG1可能是MDD的新型治疗靶标提供了证据。
图注:circSTAG1在CUS小鼠和MDD患者中表达下调
3、环状RNA circCCDC9充当miR-6792-3p海绵,通过调节CAV1表达来抑制胃癌的进展。
标题:Circular RNA circCCDC9 acts as a miR-6792-3p sponge to suppress the progression of gastric cancer through regulating CAV1 expression.
杂志:Mol Cancer;影响因子:10.679
通讯作者:huang chen(上海交通大学附属第一人民医院)
该研究主要聚焦胃癌(GC)中circRNA的生物发生,调控,功能和机制研究。研究者首先通过RNA测序分析了circRNA在6对GC组织和相邻非肿瘤组织中的表达情况。实时定量PCR确定circCCDC9在GC组织和细胞系中的表达水平。研究结果显示,在GC组织和细胞系中均观察到circCCDC9表达明显下调。circCCDC9的表达与GC患者的肿瘤大小,淋巴结浸润,晚期临床分期和总生存率呈负相关。从功能上讲,circCCDC9的过表达在体外显著抑制了GC细胞系的增殖,迁移和侵袭,在体内则抑制了肿瘤的生长和转移,而miR-6792-3p模拟物抵消了这些作用。机理分析表明,circCCDC9充当miR-6792-3p的“ ceRNA”,以减轻miR-6792-3p对其靶基因CAV1的抑制作用,然后抑制GC的肿瘤发生。该研究结论表明,CircCCDC9通过miR-6792-3p / CAV1轴抑制GC进程中,起着抑癌作用,为GC患者提供了可利用的生物标志物和治疗靶标。
图注:胃癌组织和细胞系中circRNA表达谱
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | 影响因子 | 单位 |
1 | CircITCH海绵吸附miR-330-5p上调SIRT6、Survivin和SERCA2a改善阿霉素诱导的心脏毒性。 | The Tumor-Suppressive Human Circular RNA CircITCH Sponges miR-330-5p to Ameliorate Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity Through Upregulating SIRT6, Survivin, and SERCA2a. | Circ Res | 15.862 | 西京医院等 |
2 | 环状RNA STAG1调节星形胶质细胞功能障碍和抑郁样行为中的脂肪酸酰胺水解酶信使RNA的m6A修饰。 | N6-Methyladenosine Modification of Fatty Acid Amide Hydrolase Messenger RNA in Circular RNA STAG1-Regulated Astrocyte Dysfunction and Depressive-like Behaviors. | Biol Psychiatry | 11.501 | 东南大学医学院等 |
3 | 环状RNA circCCDC9充当miR-6792-3p海绵,通过调节CAV1表达来抑制胃癌的进展。 | Circular RNA circCCDC9 acts as a miR-6792-3p sponge to suppress the progression of gastric cancer through regulating CAV1 expression. | Mol Cancer | 10.679 | 上海交通大学医学院等 |
4 | 环状RNA 406961与ILF2相互作用,通过激活STAT3 / JNK途径调节人支气管上皮细胞中PM2.5诱导的炎症反应。 | Circular RNA 406961 interacts with ILF2 to regulate PM2.5-induced inflammatory responses in human bronchial epithelial cells via activation of STAT3/JNK pathways. | Environ Int | 7.943 | 广州医科大学第一附属医院等 |
5 | m6A修饰调节circRNA代谢。 | Modulation of circRNA Metabolism by m6A Modification. | Cell Rep | 7.815 | 意大利罗马萨皮恩扎大学等 |
6 | 环状RNA circMAST1通过海绵吸附miR-1299并调节CTNND1的表达来促进肝癌细胞的增殖和迁移。 | The circular RNA circMAST1 promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and migration by sponging miR-1299 and regulating CTNND1 expression. | Cell Death Dis | 5.959 | 哈尔滨医科大学第一附属医院等 |
7 | circ5615充当ceRNA,通过上调TNKS来促进结直肠癌的进展。 | circ5615 functions as a ceRNA to promote colorectal cancer progression by upregulating TNKS. | Cell Death Dis | 5.959 | 南京医科大学附属肿瘤医院等 |
8 | 环状RNA:一种用于皮肤疾病的新型潜在生物标记。 | Circular RNA: a novel potential biomarker for skin diseases. | Pharmacol Res | 5.574 | 大连医科大学第二医院等 |
9 | 鉴定在原发性高血压中调节WNT3 /β-catenin信号的候选lncRNA和circRNA。 | Identification of candidate lncRNAs and circRNAs regulating WNT3/β-catenin signaling in essential hypertension. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 南方医科大学顺德医院等 |
10 | Hsa-circ-000684与microRNA-186相互作用,以上调胃癌中的ZEB1,发挥致癌作用。 | Oncogenic circular RNA Hsa-circ-000684 interacts with microRNA-186 to upregulate ZEB1 in gastric cancer. | FASEB J | 5.391 | 山东大学第二医院等 |
11 | 环状RNA circMDM2通过靶向miR-532-3p/HK2促进口腔鳞状细胞癌的糖酵解。 | Circular RNA circMDM2 accelerates the glycolysis of oral squamous cell carcinoma by targeting miR-532-3p/HK2. | J Cell Mol Med | 4.658 | 天津医科大学口腔医学院等 |
12 | 环状RNA的全基因组分析验证出hsa_circ_0006719作为先天性脊柱侧弯患者潜在的新型诊断生物标志物。 | Genome-Wide Analysis of circular RNAs and validation of hsa_circ_0006719 as a potential novel diagnostic biomarker in congenital scoliosis patients. | J Cell Mol Med | 4.658 | 北京协和医院等 |
13 | 脊髓肌萎缩基因产生的转录本的调查。 | A survey of transcripts generated by spinal muscular atrophy genes. | Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech | 4.599 | 爱荷华州立大学等 |
14 | 心脏耐力训练会改变环状RNA MBOAT2的血浆特征。 | Cardiac endurance training alters plasma profiles of circular RNA MBOAT2. | Am J Physiol Heart Circ Physiol | 4.048 | 德国汉诺威医学院等 |
15 | 猪精子中环状RNA的鉴定及其与精子活力的关系评估。 | Identification of circular RNAs in porcine sperm and evaluation of their relation to sperm motility. | Sci Rep | 4.011 | 西班牙巴塞罗那基因组中心 |
16 | 缩窄性心包炎中circRNA相关ceRNA网络的全面分子表征。 | Comprehensive molecular characterization of circRNA-associated ceRNA network in constrictive pericarditis. | Ann Transl Med | 3.689 | 中国医科大学盛京医院 |
17 | 环状RNA表达谱分析揭示hsa_circ_0001368与分泌生长激素的垂体腺瘤的发展有关。 | Comprehensive Circular RNA Profiling Reveals that hsa_circ_0001368 is Involved in Growth Hormone-secreting Pituitary Adenoma Development. | Brain Res Bull | 3.103 | 扬州大学附属医院等 |
18 | 透明细胞肾癌中circRNA的全面分析和circHIPK3的抑癌功能。 | Comprehensive profiling of circRNAs and the tumor suppressor function of circHIPK3 in clear cell renal carcinoma. | J Mol Histol | 2.937 | 暨南大学附属第一医院等 |
19 | 环状RNA circ_0000337通过iR-4458 / BACH1途径促进骨肉瘤进展。 | Circular RNA circ_0000337 contributes to osteosarcoma via the iR-4458/BACH1 pathway. | Cancer Biomark | 2.859 | 青岛大学附属医院等 |
20 | 环状RNA在心血管疾病发病机制中的作用。 | Role of Circular RNAs in the Pathogenesis of Cardiovascular Disease. | J Cardiovasc Transl Res | 2.756 | 青岛大学转化医学研究所等 |
21 | 比较转录组分析揭示了亚洲黄塘龟(Meauremys mutica)中mRNA和非编码RNA的有性二态表达谱。 | Comparative transcriptome analysis reveals the sexual dimorphic expression profiles of mRNAs and non-coding RNAs in the Asian yellow pond turtle (Meauremys mutica). | Gene | 2.638 | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
22 | 生菜(莴苣)中光响应性环状RNA和共表达网络的系统鉴定和分析。 | Systematic Identification and Analysis of Light-Responsive Circular RNA and Co-expression Networks in Lettuce (Lactuca sativa). | G (Bethesda) | 2.63 | 西北农林科技大学等 |
23 | circRNA Rtn4修饰的BMSC衍生的外泌体通过海绵吸附miR-146a减弱TNF-α诱导的鼠MC3T3-E1细胞的细胞毒性和凋亡。 | Exosomes derived from circRNA Rtn4-modified BMSCs attenuate TNF-α-induced cytotoxicity and apoptosis in murine MC3T3-E1 cells by sponging miR-146a. | Biosci Rep | 2.535 | 济宁医科大学附属医院等 |
24 | 环状RNA KIF4A通过miR-152/ZEB1轴促进乳腺癌细胞迁移,侵袭并抑制细胞凋亡。 | Circular RNA KIF4A promotes cell migration, invasion and inhibits apoptosis through miR-152/ZEB1 axis in breast cancer. | Diagn Pathol | 2.528 | 河南大学护理学院 |
25 | circStrn3与大鼠模型中的骨癌疼痛调节有关。 | circStrn3 is involved in bone cancer pain regulation in a rat model. | Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai) | 2.502 | 暨南大学第一附属医院等 |
26 | CircRNA ACAP2通过吸附miR-29诱导心肌梗塞后心肌细胞凋亡。 | CircRNA ACAP2 induces myocardial apoptosis after myocardial infarction by sponging miR-29. | Minerva Med | 2.475 | 烟台市烟台山医院等 |
27 | 环状RNA在心血管疾病中的作用。 | Role of circular RNAs in Cardiovascular Disease. | J Cardiovasc Pharmacol | 2.371 | 美国宾夕法尼亚州坦普尔大学 |
28 | Circ_BMP2K增强了miR-455-3p对靶基因SUMO1的调控,从而抑制了心脏成纤维细胞的活化。 | Circ_BMP2K enhances the regulation of miR-455-3p on its target gene SUMO1 to inhibit the activation of cardiac fibroblasts. | Biochem Cell Biol | 2.014 | 山西大邑县人民医院 |
29 | CircSMARCA5通过miR-432/PDCD10轴促进前列腺癌的进展。 | CircSMARCA5 Facilitates the Progression of Prostate Cancer Through miR-432/PDCD10 Axis. | Cancer Biother Radiopharm | 1.894 | 河北医科大学第四医院等 |
30 | 肩袖肌腱病变的环状RNA表达模式和竞争性内源RNA网络 | [Circular RNA expression pattern and competing endogenous RNA network involved in rotator cuff tendinopathy]. | Zhongguo Xiu Fu Chong Jian Wai Ke Za Zhi | Not Found | 陆军军医大学第一附属医院等 |
31 | One-Double-Z Pair BaseScope™用于CircRNA自动化原位杂交检测。 | Automated One-Double-Z Pair BaseScope™ for CircRNA In Situ Hybridization. | Methods Mol Biol | Not Found | 丹麦奥尔胡斯大学等 |